Após permanência adequada no biodigestor, obteremos uma mistura gasosa composta principalmente por metano e dióxido de carbono, contendo pequenas quantidades de hidrogênio, e um lodo muito líquido, com fração sólida em torno de 5%, não totalmente estabilizado (a matéria orgânica é não completamente degradado).
O gás produz energia ou, após a separação dos seus componentes, energia e metano. Após a separação da água por meio de fitopress, esta é recuperada enquanto a fração seca é utilizada como fertilizante biológico. Qualquer excesso de nitrato pode evaporar na forma de nitrogênio inofensivo, fazendo com que o composto de qualidade descanse. Pode ser adicionado com cinzas de gaseificação utilizadas como corretivo de solo.