Après un séjour ad adeguate dans le biodigesteur, on obtiendra un mélange gazeux constitué principalement de méthane et de dioxyde de carbone, contenant de faibles quantités d’hydrogène, et une boue très liquide, avec une fraction solide autour de 5%, pas totalement stabilisée (la matière organique est pas complètement dégradé).
Le gaz produit de l’énergie ou, après séparation de ses composants, de l’énergie et du méthane. Après séparation de l’eau à l’aide d’une phytopresse, celle-ci est récupérée tandis que la fraction sèche est utilisée comme engrais biologique. Tout excès de nitrate peut s’évaporer sous forme d’azote inoffensif, faisant reposer le compost de qualité. Il peut être additionné de cendres de gazéification et utilisées comme amendement de sol (compost).